Il canale, di età romana, doveva in origine far parte di un più ampio sistema di navigazione nel lago che sarebbe dovuto giungere fino a Terracina. L’Imperatore Nerone, voleva creare un unico collegamento da Ostia fino al lago d’Averno, ma il progetto restò in parte irrealizzato. Durante l’età domizianea venne sicuramente utilizzato come accesso alla villa imperiale sul lago.
E’ in parte ancora visibile il muraglione a nord in opus reticolatum. L’alveo fu risistemato nel 700 dalla Reverenda Camera Apostolica. Sempre nel 700 furono costruiti il Ponte Rosso e la Chiusa Innocenziana, andata distrutta nel 1945.